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多序列比对在线



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双序列比对工具

EMBI 的在线双序列比对工具提供了三种选项,1)全局比对;2)局部比对;3)全基因组比对。并且每一个比对工具下提供了不同算法的选择。这里我使用的uniprot 中的AB...

详细介绍双序列比对、blast 以及多序列比对的区别,

BLAST是一种启发式算法,用于在大型数据库中寻找比对序列,是一种在局部比对基础上的近似比对算法,可以在保持较高精度的情况下大大减少程序运行的时间。算法思想描述...

使用mafft进行多序列比对

多序列比对(多序列联配,Multiple sequence alignment, MSA) 是指把多条(3 条或以上)有系统进化关系的蛋白质分子的氨基酸序列或核酸序列进行比对,尽可能地把...

多个Sanger测序结果和多序列比对结果的可视化

于是,我们会同时对同一个片段,收到数个.ab1文件。使用这个功能比较简单,首先是打开这个功能 将.ab1文件直接拖拽或通过摁钮选择并放入其中(这里用两个文件做示例...

快速修剪-多序列比对结果-构建靠谱的进化树

所以,一般在我们得到多序列比对结果之后,用于进化树构建之前,我们会多序列比对结果进行修剪。针对多序列比对修剪,目前存在各种各样的操作,其中包括:基于个人...

知道一个基因的转录本,如何去寻找他的全长的同源序

3. 界面工具:一些在线工具提供了使用已知序列在不同物种中进行搜索的便捷方式。例如,UCSC Genome Browser和Ensembl Genome Browser都提供了跨物种比对功能,可以...

在进行实际的多重序列比对时,常采用什么样的策略

在进行实际的多重序列比对时,常采用的策略如下:手工比对方法在文献中经常看到。因为难免加入一些主观因素,手工比...

基因多重序列比对 是什么意思

多重序列比对(Multiple sequence alignment;MSA)是对三个以上的生物学序列(biological sequence),如蛋白质序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比对。一般来说...

我从网上NCBI上找到某个基因的MRNA序列,利用什么软

根据约定,所有的序列都是按照5'-3'的方向书写,所以cDNA序列应该是mRNA序列的互补,翻转序列,也就是Reverse Complement。如果你用“Reverse Complement of Seque...

质粒抽提后,进行测序,想看一下多克隆位点序列。在与

请问你是用质粒上多克隆位点附近的引物进行的测序吗?由于测序结果头部序列会受到荧光染料干扰会有几十BP序列不是很准确,你需要双向测序后进行拼接,连成一条链后...

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